Форум монтаж: Ошибка: org.springframework.security.web.firewall.RequestRejectedException
Custom fNIRS Montage — 💬 Поддержка и обсуждение
Конфигурация:
- Python: 3.10.6
- Версия MNE: напр. 1.1.1
- операционная система: Windows 10
Для своих исследований я использую Shimadzu Foire-300 и могу правильно создавать файлы RawArray. Однако у меня возникают проблемы с созданием правильного файла DIGMontages. Я пытался следить за вашими ответами в других обсуждениях поддержки, но безрезультатно.
Из-за того, что Foire-3000 не возвращает данные оптической плотности, у нас есть только массив RawArray, использующий данные hbo и hbr, настройка монтажа и построение графика, похоже, работают разумно. Однако при применении монтажа к RawArray я получаю следующую ошибку:
ValueError : «S10» отсутствует в списке
и ранее Я получаю предупреждение:
«Рассмотрите возможность установки типов каналов ЭЭГ/сЭЭГ/ЭКоГ/DBS/fNIRS с использованием inst.set_channel_types перед вызовом inst. set_montage или пропустите эти каналы при создании монтажа».
Я чувствую, что эти два сообщения связаны, но не знаю, как это решить. Я безрезультатно пытался установить типы каналов и попытался уменьшить двойные имена каналов hbo / hbr, чтобы они включали только каналы hbo.
Я просмотрел исходный код и заметил, что .set_montage разбивает имена каналов на «_», а затем пытается индексировать имена каналов по частям split[0] и split[1]. Однако, похоже, здесь что-то пошло не так, и я действительно не знаю, какой шаг мне следует предпринять, чтобы правильно создать расположение датчиков для моих данных.
Надеюсь найти ответ на пару вопросов:
- если у меня есть каналы hbr/hbo нужно ли настраивать цифровой монтаж на 51 или 102 канала?
- Правильно ли я настроил названия каналов и координаты?
- с моими ограниченными координатами, какая система координат лучше: МРТ, голова или неизвестно?
dict_ch_pos = {'CH01': [18.592699,1.143265,0.035148],
'CH02': [19.784060,-0.518858,0.582227],
'CH03': [20.
045658,2.546851,1.358827],
'CH04': [21.237019,0.884728,1.905906],
'CH05': [22.308882,2.177669,3.590291],
'CH06': [22.028385,-0.860704,2.789638],
'CH07': [23.100250,0.432237,4.474023],
'CH08': [22.186592,-2.375688,3.622757],
'CH09': [23.533587,-1.708249,5.490698],
'Ч20': [20.172302,-4.454614,2.717572],
'Ч21': [19.629038,-5.999544,3.692056],
'Ч22': [23.853470,1.283925,6.363868],
'Ч23': [24.052835,2.320395,8.230345],
'Ч24': [24.286806,-0.856561,7.380543],
'Ч25': [24.654545,0.123084,9.371391],
'Ч26': [22.032858,-4.311061,4.570611],
'Ч27': [23.379852,-3.643623,6.438551],
«Ч28»: [21.489594,-5.855992,5.545094],
'Ч29': [22.770203,-5.327726,7.428386],
«Ч30»: [23.921515,3.355422,10.225385],
'Ч31': [24.523224,1.158112,11.366430],
«Ч32»: [24.264742,2.225241,12.942490],
'Ч33': [24.269310,-2.790230,8.423134],
«Ч34»: [24.637049,-1.810584,10.413981],
'Ч35': [23.659660,-4.474334,9.412968],
'Ч36': [24.405617,-3.806060,10.992815],
'Ч37': [20.475264,-7.167827,6.455670],
«Ч38»: [21.755871,-6.639562,8.338962],
«Ч39»: [20. 354549,-7.999532,9.109634],
«Ч40»: [24.870075,-0.883081,12.037460],
«Ч41»: [24.611593,0.184047,13.613520],
«Ч42»: [24.638643,-2.878557,12.616294],
«Ч43»: [24.162529,-1.678006,14.749978],
'Ч44': [22.862587,-6.316775,9.948372],
«Ч45»: [23.608543,-5.648501,11.528219],
«Ч46»: [21.461266,-7.676744,10.719044],
'Ч47': [22.111305,-7.034263,12.792088],
«Ч48»: [23.651363,1.391631,15.641346],
'Ч49':[23.202301,-0.470422,16.777805],
«Ч50»: [21.732430,0.917597,18.418945],
«Ч51»: [23.710838,-4.589693,13.759712],
«Ч52»: [23.234724,-3.389143,15.893396],
'Ч53': [22.213600,-5.975455,15.023582],
«Ч54»: [21.789673,-4.992026,16.664827],
«Ч55»: [19.345104,-8.401552,12.134482],
«Ч56»: [19.995142,-7.759070,14.207526],
'Ч57': [22.166668,-2.121834,17.673340],
'Ч58': [20.696796,-0.733815,19.314480],
«Ч59»: [20.721615,-3.724717,18.444771],
'CH50': [20.089256,-7.278500,15.619411],
'CH51': [19.665329,-6.295071,17.260658]}
имена_каналов = [
'S1_D1 hbo', 'S1_D1 hbr', # 1
'S2_D1 hbo', 'S2_D1 hbr', # 2
'S1_D2 hbo', 'S1_D2 hbr', # 3
'S2_D2 hbo', 'S2_D2 hbr', # 4
'S3_D2 hbo', 'S3_D2 hbr', # 5
'S2_D3 hbo', 'S2_D3 hbr', # 6
'S3_D3 hbo', 'S3_D3 hbr', # 7
'S4_D3 hbo', 'S4_D3 hbr', # 8
'S6_D3 hbo', 'S6_D3 hbr', # 9
'S4_D4 hbo', 'S4_D4 hbr', # 10
'S7_D4 hbo', 'S7_D4 hbr', # 11
'S3_D5 hbo', 'S3_D5 hbr', # 12
'S5_D5 hbo', 'S5_D5 hbr', # 13
'S6_D5 hbo', 'S6_D5 hbr', # 14
'S8_D5 hbo', 'S8_D5 hbr', # 15
'S4_D6 hbo', 'S4_D6 hbr', # 16
'S6_D6 hbo', 'S6_D6 hbr', # 17
'S7_D6 hbo', 'S7_D6 hbr', # 18
'S9_D6 hbo', 'S9_D6 hbr', # 19
'S5_D7 hbo', 'S5_D7 hbr', # 20
'S8_D7 hbo', 'S8_D7 hbr', # 21
'S10_D7 hbo', 'S10_D7 hbr', # 22
'S6_D8 hbo', 'S6_D8 hbr', # 23
'S8_D8 hbo', 'S8_D8 hbr', # 24
'S9_D8 hbo', 'S9_D8 hbr', # 25
'S11_D8 hbo', 'S11_D8 hbr', # 26
'S7_D9 hbo', 'S7_D9 hbr', # 27
'S9_D9 hbo', 'S9_D9 hbr', # 28
'S12_D9 hbo', 'S12_D9 hbr', # 29
'S8_D10 hbo', 'S8_D10 hbr', # 30
'S10_D10 hbo', 'S10_D10 hbr', # 31
'S11_D10 hbo', 'S11_D10 hbr', # 32
'S13_D10 hbo', 'S13_D10 hbr', # 33
'S9_D11 hbo', 'S9_D11 hbr', # 34
'S11_D11 hbo', 'S11_D11 hbr', # 35
'S12_D11 hbo', 'S12_D11 hbr', # 36
'S14_D11 hbo', 'S14_D11 hbr', # 37
'S10_D12 hbo', 'S10_D12 hbr', # 38
'S13_D12 hbo', 'S13_D12 hbr', # 39
'S15_D12 hbo', 'S15_D12 hbr', # 40
'S11_D13 hbo', 'S11_D13 hbr', # 41
'S13_D13 hbo', 'S13_D13 hbr', # 42
'S14_D13 hbo', 'S14_D13 hbr', # 43
'S16_D13 hbo', 'S16_D13 hbr', # 44
'S12_D14 hbo', 'S12_D14 hbr', # 45
'S14_D14 hbo', 'S14_D14 hbr', # 46
'S13_D15 hbo', 'S13_D15 hbr', # 47
'S15_D15 hbo', 'S15_D15 hbr', # 48
'S16_D15 hbo', 'S16_D15 hbr', # 49'S14_D16 hbo', 'S14_D16 hbr', # 50
'S16_D16 hbo', 'S16_D16 hbr', # 51
]
#### Реперные точки и масштабирование
nasion = [x*0,01 для x в [11. 232580,0.487142,0.482432]]
lpa = [x*0,01 для x в [8,851848,6,727137,10,000131]]
rpa = [x*0,01 для x в [9,345170, -6,998555,8,775833]]
hsp = [x*0,01 для x в [24,690950,-0,762161,11,439560]]
для k, v в dict_ch_pos.items():
dict_ch_pos[k] = [x*0,01 для x в v]
конечная_позиция = [.]
для x в dict_ch_pos.values():
final_pos.append(x)
final_pos.append(x)
значения = список (dict_ch_pos.values())
местоположения = dict (zip (chan_names, final_pos))
chan_types = ['hbo', 'hbr'] * 51
channel_types = dict(zip(chan_names, chan_types))
montage = mne.channels.make_dig_montage(ch_pos=locations, nasion=nasion, lpa=lpa, rpa=rpa, coord_frame='head')
info = mne.create_info(ch_names=chan_names, ch_types=chan_types, sfreq=sfreq)
raw_haemo = mne.io.RawArray(ndata, info, verbose=True)
raw_haemo.info['bads'] = ['S2_D3 hbo', 'S2_D3 hbr', 'S3_D3 hbo', 'S3_D3 hbr', 'S4_D3 hbo', 'S4_D3 hbr', 'S6_D3 hbo', 'S6_D3 hbr']
raw_haemo.set_channel_types(channel_types)
raw_haemo.set_montage(монтаж)
raw_haemo.plot_sensors()
045658,2.546851,1.358827],
'CH04': [21.237019,0.884728,1.905906],
'CH05': [22.308882,2.177669,3.590291],
'CH06': [22.028385,-0.860704,2.789638],
'CH07': [23.100250,0.432237,4.474023],
'CH08': [22.186592,-2.375688,3.622757],
'CH09': [23.533587,-1.708249,5.490698],
'Ч20': [20.172302,-4.454614,2.717572],
'Ч21': [19.629038,-5.999544,3.692056],
'Ч22': [23.853470,1.283925,6.363868],
'Ч23': [24.052835,2.320395,8.230345],
'Ч24': [24.286806,-0.856561,7.380543],
'Ч25': [24.654545,0.123084,9.371391],
'Ч26': [22.032858,-4.311061,4.570611],
'Ч27': [23.379852,-3.643623,6.438551],
«Ч28»: [21.489594,-5.855992,5.545094],
'Ч29': [22.770203,-5.327726,7.428386],
«Ч30»: [23.921515,3.355422,10.225385],
'Ч31': [24.523224,1.158112,11.366430],
«Ч32»: [24.264742,2.225241,12.942490],
'Ч33': [24.269310,-2.790230,8.423134],
«Ч34»: [24.637049,-1.810584,10.413981],
'Ч35': [23.659660,-4.474334,9.412968],
'Ч36': [24.405617,-3.806060,10.992815],
'Ч37': [20.475264,-7.167827,6.455670],
«Ч38»: [21.755871,-6.639562,8.338962],
«Ч39»: [20.
Я ценю все усилия помочь и заранее благодарю вас!
Ура,
Джим
Часы Montage | Форумы WatchUSeek Watch
JavaScript отключен.